Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sft2d1Q5SSN7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms