Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Utp18Q5SSI6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Utp18Q5SSI6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms