Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms