Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mdc1Q5PSV9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms