Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8M2

Odf3b, Outer dense fiber protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3bQ5M8M2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Odf3bQ5M8M2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms