Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkaa1Q5EG47 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prkaa1Q5EG47 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms