Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nlrc3Q5DU56 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Nlrc3Q5DU56 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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