Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfmbt2Q5DTW2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms