Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam208bQ5DTT3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms