Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f8Q58FA4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms