Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrig2Q52KR2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrig2Q52KR2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms