Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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C1qtnf9Q4ZJN1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
C1qtnf9Q4ZJN1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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