Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBE8

Wdr18, WD repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr18Q4VBE8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Wdr18Q4VBE8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms