Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trp53i11Q4QQM4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trp53i11Q4QQM4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trp53i11Q4QQM4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trp53i11Q4QQM4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trp53i11Q4QQM4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trp53i11Q4QQM4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trp53i11Q4QQM4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trp53i11Q4QQM4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trp53i11Q4QQM4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trp53i11Q4QQM4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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