Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10488Q4KL05 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms