Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppp4r3cQ3V0Y1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppp4r3cQ3V0Y1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppp4r3cQ3V0Y1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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