Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Garnl3Q3V0G7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms