Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kdm5aQ3UXZ9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm5aQ3UXZ9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms