Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnga4Q3UW12 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnga4Q3UW12 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms