Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap1Q3UUV5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms