Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fchsd2Q3USJ8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms