Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm28047Q3US59 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28047Q3US59 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms