Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp30Q3UN04 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp30Q3UN04 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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