Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lsg1Q3UM18 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lsg1Q3UM18 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms