Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp19Q3UJD6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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Usp19Q3UJD6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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Usp19Q3UJD6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp19Q3UJD6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp19Q3UJD6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp19Q3UJD6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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