Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sf3b2Q3UJB0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms