Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm648Q3UJ22 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm648Q3UJ22 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm648Q3UJ22 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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