Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmod2Q3UHZ5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmod2Q3UHZ5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms