Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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