Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pitpnm3Q3UHE1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms