Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pid1Q3UBG2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pid1Q3UBG2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pid1Q3UBG2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pid1Q3UBG2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pid1Q3UBG2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms