Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trip13Q3UA06 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms