Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Cops9Q3U898 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Cops9Q3U898 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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