Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Rnf180Q3U827 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf180Q3U827 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Rnf180Q3U827 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Rnf180Q3U827 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Rnf180Q3U827 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Rnf180Q3U827 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Rnf180Q3U827 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Rnf180Q3U827 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Rnf180Q3U827 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Rnf180Q3U827 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf180Q3U827 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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