Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q3U6N9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U6N9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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