Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ulk3Q3U3Q1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ulk3Q3U3Q1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ulk3Q3U3Q1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ulk3Q3U3Q1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ulk3Q3U3Q1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ulk3Q3U3Q1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ulk3Q3U3Q1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk3Q3U3Q1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ulk3Q3U3Q1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ulk3Q3U3Q1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ulk3Q3U3Q1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ulk3Q3U3Q1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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