Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gse1Q3U3C9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gse1Q3U3C9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms