Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rnf40Q3U319 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf40Q3U319 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf40Q3U319 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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