Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Kdm4dQ3U2K5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms