Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms