Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Serac1Q3U213 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms