Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Palb2Q3U0P1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms