Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim43aQ3TL54 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms