Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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