Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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