Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN8

Defb25, Beta-defensin 25, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb25Q30KN8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defb25Q30KN8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Defb25Q30KN8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb25Q30KN8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms