Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna5Q2MKA5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna5Q2MKA5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms