Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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Shroom4Q1W617 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shroom4Q1W617 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
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