Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Spatc1Q148B6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Spatc1Q148B6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spatc1Q148B6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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