Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisal1Q0VBP7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shisal1Q0VBP7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms